В центре сюжета — Макото, гениальный юноша, который мастерски умеет хранить дистанцию от окружающих. Его необычное увлечение — женская одежда — часто воспринимается многими как вызов общественным нормам и вызывает постоянные разговоры за спиной. Привыкнув к косым взглядам и пересудам, Макото научился избегать ненужного внимания, находя истинный покой и равновесие в одиночестве. Ему казалось, что такой образ жизни максимально прост: никто не вмешивается в его внутренний мир, никто не осуждает в лицо, и он может быть самим собой без лишних объяснений. Макото очень дорожил своим теперешним состоянием, где ему не нужно было притворяться или соответствовать чьим-то ожиданиям.
Однако один школьный день, казавшийся вполне обычным, завершился событием, которое Макото никак не мог предвидеть. Девушка по имени Саки, которую он раньше почти не замечал в школьных коридорах, неожиданно подошла к нему с удивительной решимостью. В её взгляде горела смелость, а в голосе, дрожащем от волнения, слышалась неподдельная искренность. Саки произнесла несколько слов, признаваясь Макото в давно испытываемой к нему симпатии. Для неё это был невероятно смелый поступок, требующий огромной отваги и преодоления собственного смущения.
Макото замолчал на мгновение, переваривая услышанное. Его ответ был спокойным, лишенным какой-либо жесткости, но при этом предельно ясным. Он деликатно пояснил Саки, что её восприятие его личности, возможно, связано исключительно с его внешностью, которая не отражает всей его сути и внутренних убеждений. Он честно, но при этом очень мягко, сказал, что не ищет романтических отношений и очень дорожит своим нынешним состоянием уединения и внутренней гармонии. Его слова были понятны, но при этом лишены какой-либо холодности или надменности. Казалось, он хотел сохранить достоинство девушки, не ранив её чувства, несмотря на свой отказ.
Этот короткий, но невероятно значимый разговор оставил глубокий и неизгладимый след в жизни обоих героев. Для Саки это стало важным шагом в попытке быть предельно искренней, отважно выразив свои чувства, несмотря на риск. Для Макото же это было напоминанием, что даже в самом глубоком одиночестве, которое он так ценил, всегда найдётся тот, кто решится приблизиться, кто увидит нечто большее, чем просто внешность или слухи. Аниме «Моя сэмпай — парень? Солнечно после дождя» — это история о принятии себя, смелости признаний, сложностях восприятия и ценности истинной индивидуальности в современном мире.
